Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEIL3Q8TAT5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms