Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms