Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms