Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00612Q8N6U2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms