Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms