Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms