Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms