Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM72Q6ZMU5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms