Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLRC1Q6VVB1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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