Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms