Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms