Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms