Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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