Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP350Q5VT06 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms