Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C17orf58Q2M2W7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C17orf58Q2M2W7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C17orf58Q2M2W7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C17orf58Q2M2W7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C17orf58Q2M2W7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C17orf58Q2M2W7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C17orf58Q2M2W7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms