Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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