Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDR2Q16832 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms