Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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