Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FXNQ16595 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms