Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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