Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms