Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATP6AP1Q15904 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATP6AP1Q15904 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ATP6AP1Q15904 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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ATP6AP1Q15904 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP6AP1Q15904 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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