Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms