Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms