Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TAF1AQ15573 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TAF1AQ15573 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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