Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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