Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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BRD3Q15059 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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