Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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