Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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KCNC3Q14003 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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KCNC3Q14003 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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KCNC3Q14003 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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KCNC3Q14003 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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KCNC3Q14003 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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