Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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