Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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