Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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