Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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