Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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