Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPM6BQ13491 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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