Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms