Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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