Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms