Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTK7Q13308 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms