Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CHAF1BQ13112 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CHAF1BQ13112 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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