Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms