Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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