Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM27E3Q08E93 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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