Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms