Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms