Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms