Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms