Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APBA1Q02410 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APBA1Q02410 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms