Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms