Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN7AQ01118 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms